Opracowanie problemów do egzaminu.pdf

Uniwersytet Jagiello«ski

Fizyka Medyczna

Opracowanie problemów

do egzaminu z biochemii

Autorzy:

Małgorzata Florek (19-33)

Joanna Kami«ska (34-48)

Aleksandra Kubica (64-78)

Agnieszka Milewska (79-93)

Aleksandra Skowro«ska (94-108)

Grzegorz Brzezinka (1-18)

Marcin Kret (49-63)

29 grudnia 2006

SPIS TRECI

Spis tre±ci

1 Cechy »ywych organizmów

2 Kiedy organizm zaliczmy do istot »ywych?

3 Ró»nice mi¦dzy robotem a organizmem »ywym

4 Autoreplikacja i autoregulacja

5 Skład pierwiastków w biomolekułach

6 Wymie« etapy powstawania komórki z prostych prekursorów: CO 2 , H 2 O, N 2 , CH 4

7 Zasada zachowania I i II prawa termodynamiki przez organizmy »ywe

8 Sposoby zdobywania energii przez autotrofy

9 Sposoby zdobywania energii przez heterotrofy

10 Teorie powstania »ycia na Ziemii

11 Typy wi¡za« wyst¦puj¡ce w biomolekułach

12 Wi¡zanie kowalencyjne

13 Wi¡zanie jonowe

14 Wi¡zanie wodorowe

15 Wi¡zanie hydrofobowe

16 Porównanie składu skorupy ziemskiej ze składem pierwiastkowym »ywych organizmów

17 Deﬁnicja kwasu i zasady wg teorii Bronsteda i Lowry

18 Bufory

19 Podział aminokwasów ze wzgl¦du na rol¦ w »ywieniu

20 Aminokwasy endo- i egzogenne

21 Narysuj wzory Trp, Phe, Met

22 Sposoby oznaczania grupy aminowej w wolnych i zwi¡zanych aminokwasach

23 Sposoby oznaczania grup -COOH

24 Jak oznacza si¦ grupy R ró»nych aminokwasów

25 Wa»ne biologicznie polipeptydy

26 Białka - zale»no±¢ struktury i funkcji

27 Podział białek ze wzgl¦du na struktur¦

28 Podział białek ze wzgl¦du na funkcj¦

29 Białka proste - budowa, przykłady

30 Białka zło»one - budowa, podział, przykłady

SPIS TRECI

31 Oznaczanie struktury I-rz¦dowej białek

32 Co nazywamy struktur¡ I-rz¦dow¡ i II-rz¦dow¡

33 Charakterystyka białek zło»onych - przykłady

49 Kiedy cukry wykazuj¡ wła±ciwo±ci redukcyjne?

50 Rodziny monosacharydów (szereg D aldoz)

51 Rodziny monosacharydów (szereg D ketoz)

52 Co to s¡ epimery (przykłady)?

53 Anomeryczne odmiany cukrów.

54 Pochodne cukrowców (9 podstawowych grup).

55 Co to s¡ aminocukry i gdzie wyst¦puj¡?

56 Disacharydy

57 Homoglikany

58 Heteroglikany

59 Glikoproteiny jako przykład heteroglikanów.

60 Cz¦±¢ cukrowa glikoprotein (budowa, rola biologiczna).

61 Biosynteza cz¦±ci cukrowej glikoprotein.

64 Mono-, di- oraz triacyloglicerole

65 Sﬁngozyna i jej pochodne

66 Fosfolipidy

67 Glikolipidy

68 Fosfolipazy i produkty ich działania

69 Nukleotydy wolne i zwi¡zane

70 Elementy składowe kwasów nukleinowych

71 Składniki nukleotydów

72 Najwa»niejsze pochodne puryn

73 Najwa»niejsze pochodne pirymidyn

74 Rodzaje RNA

75 Biologiczna rola mRNA, rRNA i tRNA

76 Budowa DNA i jego rola biologiczna

77 Semikonserwatywny charakter replikacji DNA

78 Biosynteza białka na matrycy DNA

SPIS TRECI

79 Obieg w¦gla i tlenu w biosferze

80 Obieg energii w biosferze

81 Obieg azotu w przyrodzie

82 Trzy etapy anabolizmu i katabolizmu

83 Biomolekuły o wi¡zaniach wysokoenergetycznych

84 Cz¡stki magazynuj¡ce energi¦ w »ywych organizmach

85 Przepływ grup fosforanowych z udziałem nukleozydo 5-trifosforanów

86 Fermentacje

87 Oddychanie

88 Porównanie glikolizy, fermentacji i oddychania

89 Cykl kwasów trikarboksylowych

90 Fotosynteza

91 Trzy rodzaje fosforylacji (substratowa, oksydacyjna, fotosyntetyczna)

92 Katabolizm białek

93 Katabolizm w¦glowodanów

4 AUTOREPLIKACJA I AUTOREGULACJA

1 Cechy »ywych organizmów - wymieni¢ i uzasadni¢

Co to znaczy, »e co± »yje ) nie potraﬁmy dokładnie powiedzie¢.

Zgodnie z przyj¦t¡ umow¡, za »ywy organizm uznaje si¦ obiekt spełniaj¡cy 3 poni»sze warunki:

1. Zło»ono±¢ i wysoki stopie« organizacji - pozwala na samodzielne utrzymanie wła±ciwych struk-

tur; tzn. wysoki stopie« organizacji pozwala organizmowi na zachowanie ni»szej entropii ni» otoczenie

(kosztem zu»ywanej energii); cechy te uzyskane zostały w procesie ewolucji .

2. Pobieranie i przekształcanie energii - wykonywanie pracy - procesy metaboliczne, do podtrzymy-

wania wymiany energii z otoczeniem konieczny jest stały wkład wysiłku ze strony organizmu ) ci¡gła

wymiana materii i energii mi¦dzy organizmem a otoczeniem; entropia ±rodowiska wzrasta podczas eks-

ploatowania go przez organizm.

3. Samoodtwarzanie - a wi¦c zdolno±¢ do przechowywania i powielania informacji o swojej budowie (np.

w DNA), dalej mo»liwo±¢ do replikacji i rozmno»enia.

Organizm mo»e »y¢ tylko w jakim± ±rodowisku , w pró»ni doskonałej nie istniej¡ »ywe organizmy. Uwaga: w my±l

tej deﬁnicji, wirusy (zlepki białek i kw. nukleinowych) nie s¡ organizmami »ywymi (poniewa» nie spełniaj¡

warunku 3. - do rozmna»ania wymagana jest obca komórka, któr¡ infekuj¡).

2 Kiedy organizm zaliczmy do istot »ywych?

Kiedy posiada cechy wymienione w pkcie. 1. Skład chemiczny: patrz punkt 5. Za materiałami z wykładów :

materia organiczna - zwi¡zki zawieraj¡ce C,O,H,N,S,P (memo: pan COHN i SPółka ).

3 Ró»nice mi¦dzy robotem a organizmem »ywym

Pytanie - rzeka. Podaj¦ odpowied¹ na podstawie patrzenia na pytanie 1. przez pryzmat sztucznego robota

(mechanicznego).

Ad. 1.1 Robota cechuje zło»ono±¢ i wysoki sposób organizacji, jednak został on nadany przez obcy organizm

(człowieka) - nie został wytworzony samoistnie w procesie ewolucji. Zwykle nie jest w stanie samodzielnie

utrzyma¢ zło»ono±ci struktur, tzn. w razie uszkodzenia wymaga interwencji twórcy/serwisanta .

Ad. 1.2 Zwykle energia nie jest czerpana ze ±rodowiska, lecz z wbudowanych ogniw (wyj¡tek: czerpanie energii

±rodowiska przez ogniwa słoneczne). Procesy metaboliczne nie opieraj¡ si¦ na reakcjach chemicznych, lecz na

mechanicznych cz¦±ciach zasilanych energi¡ elektryczn¡ (wyj¡tek: procesy zachodz¡ce w ogniwach chemicz-

nych). Do podtrzymywania wymiany energii z otoczeniem zwykle nie jest wymagany wysiłek ) robot czerpie

”gotow¡” energi¦ elektryczn¡ w czystej postaci np. z gniazdka elektrycznego.

Ad. 1.3 O ile roboty mog¡ przechowywa¢ informacj¦ o swojej budowie (np. w postaci schematu poł¡cze«

elektrycznych i bazy elementów), o tyle nie maj¡ wykształconych wewn¦trznych struktur umo»liwiaj¡cych sa-

modzielne powielenie - potrzebuj¡ do tego gotowych bardzo ju» zło»onych cz¦±ci.

Wszystkie przedstawione powy»ej cechy odnosz¡ si¦ do obecnie istniej¡cych robotów; istniej¡ wyj¡tki, które

spełniaj¡ który± z powy»szych warunków, jednak »aden z powstałych dotychczas robotów nie spełnia wszystkich

3 cech »ywych organizmów jednocze±nie. Dodatkowo: Cybernetyczna deﬁnicja »ycia ycie to system sprz¦»e«

zwrotnych ujemnych podporz¡dkowanych nadrz¦dnemu sprz¦»eniu zwrotnemu dodatniemu.

4 Wyja±ni¢ poj¦cia autoreplikacja i autoregulacja

Autoreplikacja (samoodtwarzanie) - wi¡»e si¦ z przechowywaniem przez organizm informacji o swojej bu-

dowie, obecno±ci¡ mechanizmów umo»liwiaj¡cych, przy obecno±ci odpowiednich elementów składowych (sub-

stratów), do odtworzenia i skopiowania swojego organizmu - czyli rozmna»anie.

Autoregulacja - przypuszczam, »e chodzi tutaj o homeostaz¦ (gr. homoıos - podobny, równy i stasis - trwa-

nie), czyli o stan dynamicznej równowagi wewn¦trznej organizmu. Mo»e by¢: ﬁzjologiczna (czyli np. regulacja

ci±nienia krwi) lub behawioralna (jest gor¡co ) znajdujemy cie«). Wi¡»e si¦ bezpo±rednio z mechanizmem

sprz¦»enia zwrotnego :

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika: