1. Które stwierdzenia dotyczące transkrypcji genów u E.coli są prawdziwe?
a) produktem może być policistronowy mRNA
b) faza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzeń polimerazy
c) polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazową, która umożliwia jej korekcję błędów
d) rRNA (tzw.odwrotny RNA) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5’à3’, stąd jego nazwa
e) pre-mRNA podlega procesowi składania (slicingu) jeszcze zanim zajdzie translacja
f) ekspresja genów jest kontrolowana głównie na poziomie transkrypcji
2. Przykładami przedtranslacyjnej kontroli ekspresji genów u Eukaryota są:
a) alternatywny splicing pre-mRNA, dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu
b) rozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych
c) glikozylacja i fosforylacja polipeptydów, aby mogły się stać funkcjonalnymi białkami
d) selektywna degradacja cząsteczek mRNA
e) regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację
f) selektywne składanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….
3. Które stwierdzenia dotyczące ekspresji genów u Eukaryota są poprawne?
a) geny w obrębie upakowanej chromatyny są aktywne
b) aktywatory i represory działają poprzez zmianę szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego
c) zaktywowane związanym hormonem receptory wiążą się ze specyficznymi sekwencjami…….”… elementami odpowiedzi na hormon”
d) rejony chromosomów, w których aktywnie zachodzi transkrypcja nazywamy „pufami” …szczególnie zwartą strukturą DNA
e) większość genów Eukaryota znajduje się pod kontrolą jednego aktywatora i jednego represora
f) w wielu białkach kontrolujących ekspresję genów, wiążących się specyficznie do….. „palca cynkowego”
4. Które stwierdzenia dotyczące roli białek ochronnych są poprawne?
a) wiążą się z rosnącymi łańcuchami polipeptydowymi
b) umożliwiają na zwykle niedozwolone interakcje pomiędzy cząsteczkami
c) są powolnie działającymi ATPazami
d) przykładem jest grupa białek szoku termicznego
e) kompleks ADP-chaoperon ma duże powinowactwo do białek rozfałdowanych
f) żadne z powyższych
5. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących sekwencji sygnałowych są poprawne?
a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER
b) cząsteczką rozpoznającą sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z …
c) uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu
d) SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka
e) cykl ATP-ADP…sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …
f) rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę
6. Które stwierdzenia na temat aminoacylo-tRNA są poprawne?
a) wiązanie estrowe w aminoacylo-tRNA tworzone jest między grupą karboksylową aminokwasu a grupą fosforanową tRNA
b) dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego …
c) rodzaj aminokwasu przyłączanego do tRNA zależy od rodzaju syntetazy … jest substratem
d) niektóre syntetazy aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjną … niewłaściwym tRNA
e) wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA rozpoznają właściwy tRNA rozpoznając …
f) aminokwas połączony z tRNA odgrywa istotną rolę w rozpoznaniu …
7. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących sygnałów rozpoczynających i kończących transkrypcję są poprawne?
a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka α polimerazy RNA
b) typowe promotory E.coli zawierają w obrębie -10 tzw. kasetę TATA o sekwencji zgodnej TATAA
c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
d) sygnałem terminacji transkrypcji jest cześć RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU
e) heksameryczne białko rho jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w … niektórych genów E.coli
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami … określonych genów do potrzeb pokarmowych komórki
8. Pytanie na temat syntezy białka u Prokaryota?
a) hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia uwolnienie …
b) energia potrzebna do utworzenia wiązań peptydowych … peptydylotransferazę
c) puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha … umożliwiając tym samym przesunięcie deacylowanego …
9. (brak pytania)
a) ponieważ transkrypcja zachodzi w jadrze komórkowym, a translacja w cytoplazmie, konieczny jest transport transkryptów z jądra do cytozolu
b) ponieważ wszystkie pierwotne transkrypty zawierają introny, konieczny jest splicing
c) pierwotne transkrypty tRNA podlegają intensywnej obróbce potranskrypcyjnej, po … transestryfikacji zbliżone mechanizmem do splicingu pre-mRNA
d) struktura określana mianem „kap” tworzona jest na końcu 5’ większości mRNA oraz …
e) większość genów kodujących mRNA jest rozcinana przez endonukleazę rozpoznającą … od końca 3’ przez polimerazę poli(A)
f) cząsteczki pre-mRNA kodujące część białek podlegają procesowi redagowania co, … transkryptu nie jest w pełni zgodna z sekwencją odpowiedniego egzonu w genie kodującym …
10. Kierowanie białek:
a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę
b) cząsteczki rozpoznające SRP to białka składające się z 7 łańcuchów polipeptydowych
c) uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zakończenie elongacji
d) SRP zapobiega przed elongacją i fałdowaniem
e) rozfałdowanie łańcuchów polipeptydowych – optymalna substancja do transportu
11. Translacja mRNA u Prokaryota:
a) 1 kodon AUG od końca 5’ transkryptu hydrolizującego ATP
b) równanie reakcji: …
c) cząsteczka elongacyjna Ts wiąże GTP, podlega hydrolizie EF-Ts do GDP
d) cząsteczka elongacyjna Tu oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacylo-tRNA oprócz fMet-RNAf
e) peptydylo-tRNA może zajmować miejsce P lub A zależnie od tego, w którym cyklu komórkowym się znajduje
f) fMet-tRNA zajmuje miejsce P (jako jedyne)
12. Transkrypt o sekwencji 5’ AAUUGUAA 3’
RNA 5’ AAUUGUAA 3’
DNAMATRYCOWA, ANTYSENSOWNA 3’ TTAACAT T 5’ à 5’TTACAATT 3’
Komplementarna nić do transkryptu
DNAKODUJACA, SENSOWNA 5’ AATTGTAA 3’
13. Histony – modyfikacje potranslacyjne na końcu N’
a) ulegają acetylacji , fosforylacji , ATP-zowane , ubikwitynacji
b) wystawienie ogonów na działanie acetylaz
c) acetylacja reszt Lys w ogonach histonowych (Lys i Arg mogą być!)
d) kod histonowy – było coś o tym, że kod histonowy jest informacją czy zbiorem informacji o modyfikacjach czy coś takiego.
14. Operon laktozowy
a) y koduje β-galaktozydaze (z koduje beta-galaktozydazę, a y permeazę)
b) tworzy wiązanie 1,6-βglikozydowe w allolaktozie
c) katalizuje tworzenie glukozy i czegoś tam jeszcze (nieprawda, bo glukozy i galaktozy)
d) katalizuje syntezę laktozy z glukozy i galaktozy
e) łączy z kompleksem CAP-cAMP w miejscu operatorowym (to jest źle bo ten kompleks łączy się z miejscem tzw. CAP-site, a nie z operatorem)
15. Enzymy restrykcyjne. Pocięto liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV , obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu. Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku poniżej? Żel wybarwiono bromkiem etydyny. Zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 pz.
a) W żelu znajduje się bromek etydyny
b) Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych miejsc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym (tak, bo to był liniowy DNA i powstało 6 kawałków, czyli 5 miejsc restrykcyjnych)
c) Długość cząsteczki Dna wynosi 2220 pz
d) Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 210 pz
e) Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 2220 pz
f) Żadna z powyższych nie jest prawdziwa
g) Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera (nie, bo w metodzie dideoksy Sangera nie stosuje się elektroforezy, tylko robi się autoradiogram, a elektroforezę stosuje się do metody Southern)
17. Represor λ
- gdzie się łączy białko cro i co robi - łączy się z OR3
- kiedy faza lityczna, kiedy lizogenna
- w swoim cyklu lizogennym ma taki okres, że powstaje hybryd DNA-RNA
- faza lizogenna jest utrzymywana dzięki działaniu represora lambda
18. Redagowanie RNA
- dodatkowa zmienność genetyczna
- zachodzi już po transkrypcji
- zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A) (inny przykład to deaminaza przy apolipoproteinie B 100 i 48)
- zachodzi autokatalitycznie - raczej nie
19. Immunoprecypitacja
a) dotyczy to euchromatyny (czyli tej rozwiniętej chromatyny), tzn. że te przeciwciała zwiążą się z euchromatyną (bo tam jest fragment rozpleciony, czyli grupy acetylowe są na wierzchu)
b) przeciwciało łączy się do Lys na N’ końcu
c) ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie
d) mają więcej etylowanych reszt
20. Represory transkrypcji u Eucaryota
a) przyłączają się do rejonów cis, a same są trans
b) mają budowę modułową
c) mają 2 rejony wiążące
d) np. deacylacja N-końców histonów
21. Które z następujących zdań określa podwójną helisę DNA typu Watson-Crick?
a) dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi
b) tworzy pary A-C i G-T (nie, A-T i G-C)
c) helisa ma pełny obrót o 34 st., bo każda para obraca się o 36 st. względem sąsiedniej pary zasady i oddalonego 3,4 A
d) puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz
e) skład zasad analizowany z DNA wielu organizmów pokazuje ze ilość A i T jest równe, tak jak ilość G i C
f) można zmieniać sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nici
22. Wprowadzenie genu w środek wektora, który zawiera odporność na antybiotyk to:
a) prowadzi do przeniesienia odporności na leki
b) jest nazywane inaktywacją insercyjną
c) powoduje czułość komórki na antybiotyk
d) może być używany do identyfikacji bakterii zawierających wektor z fragmentem DNA
e) jest metodą niszczenia patogenicznych bakterii
23. Bardzo długi odcinek DNA z genu Eukariota ( > 100 kb)
a) może być pakowany w fag
b) może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży
c) musi posiadać końce kohezyjne do klonowania
d) może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu
e) mogą być odseparowane przez elektroforezę w żelu poliakryloamidowym
...
DWito