Bioinformatyka 2006/07 Powtórka
POWTÓRZENIE PRZED EGZAMINEM
1. Zrób profil 10 sekwencji najbardziej podobnych do ludzkiej elastazy.
2. Znajdź sąsiadów strukturalnych lizozymu z jaja kurzego.
3. Ile jest helis w białku odpowiedzialnych za fenyloketonurię.
4. Znajdź ten substrat enzymu 5.3.1.9 , który jest produktem metabolizmu galaktozy. W ilu ścieżkach metabolicznych występuje ta substancja?
5. Na którym chromosomie kodowane jest białko odpowiedzialne za fenyloketonurię?
6. Ile jest w bazie UNIPROT sekwencji rybonukleaz, do których są odniesienia do PDB?
7. Znajdź w bazie danych UNIPROT sekwencje roślinnych dehydrogenaz.
8. Zrób dotplot białka phot_bacsu z jego najbliższym homologiem.
9. Znajdź najlepszy lokalny alignment białka phot_bacsu z jego najbliższym homologiem.
10. Znajdź paralogi białka ypt7 w genomie drożdżowym.
11. Czy chloroperoksydazy z Pseudomonas fluorescens i Curvalaria inaeqalis mają taką sama budowę (fold)?
biologia